Пустыня Виктория положительно влияет на экологию Австралии, поскольку её территория используется для сельского хозяйства ограниченно, поэтому среда обитания остаётся в основном нетронутой. 3

С 1965 года существенная часть пустыни носит статус охраняемой зоны и вместе с национальным парком Мамунгари на равнине Налларбор в штате Южная Австралия считается одним из двенадцати австралийских заповедников, состоящих под эгидой ЮНЕСКО в рамках программы «Человек и биосфера». 2 Особенное внимание при этом уделяется сохранению и поддержанию естественных комплексов песчаных пустынь, каменистых гряд и солёных озёр. 2

Кроме того, несмотря на засушливость этих мест, пустыни Австралии богаты подземными водами. 4 Здесь расположено несколько крупных артезианских бассейнов, подземный резервуар которых является вторым в мире по величине, а его запасов воды может хватить для всех австралийцев на полторы тысячи лет. 4