Координация действий различных служб при проведении контртеррористических операций в России осуществляется через антитеррористические комиссии, которые создаются на федеральном и региональном уровне по решению Президента или Правительства РФ. 1

Некоторые задачи антитеррористических комиссий:

• выработка основ государственной политики в области борьбы с терроризмом; 1
• сбор и анализ информации о состоянии и тенденциях терроризма на территории РФ; 1
• координация деятельности федеральных органов исполнительной власти, осуществляющих борьбу с терроризмом; 1
• участие в подготовке международных договоров в РФ в области борьбы с терроризмом; 1
• выработка предложений о совершенствовании законодательства РФ в области борьбы с терроризмом. 1

Для управления контртеррористической операцией создаётся оперативный штаб, который возглавляет представитель Федеральной службы безопасности РФ или Министерства внутренних дел РФ в зависимости от того, чья компетенция будет преобладающей в проведении конкретной операции. 1

Некоторые функции оперативного штаба:

• сбор сведений об обстановке, обобщение, анализ и оценка информации для определения характера и масштаба готовящегося или совершаемого террористического акта; 2
• подготовка расчётов и предложений по проведению контртеррористической операции; 2
• разработка плана проведения контртеррористической операции и после утверждения плана организация контроля за его исполнением; 2
• подготовка боевых распоряжений (боевых приказов) и других документов, определяющих порядок подготовки и проведения контртеррористической операции, правовой режим операции; 2
• организация взаимодействия привлекаемых для проведения контртеррористической операции сил и средств; 2
• принятие других мер по предотвращению и минимизации последствий террористического акта. 2

Все военнослужащие, сотрудники и специалисты, привлекаемые к проведению контртеррористической операции, с момента начала операции и до её окончания подчинены руководителю оперативного штаба. 14