Аккумуляция органических остатков на дне водоёмов происходит в результате разложения отмирающей прибрежно-водной растительности и остатков водных животных. 1

При достаточном содержании в воде кислорода органические вещества быстро разлагаются. 2 Углерод и водород переходят в углекислоту и воду, азот белковых соединений — в мочевину и аммиак. 2

После того как органические остатки во взвешенных и коллоидных формах поступают в состав донных отложений, их распад и минерализация продолжаются и в анаэробных условиях. 1

На процесс формирования донных отложений влияют разные факторы, среди которых физико-географические условия региона (рельеф, климат, процессы выветривания горных пород и почв), геохимические особенности горных пород, кислотно-щелочные условия и окислительно-восстановительная обстановка в природных водах и другие. 4

В результате аккумуляции на дне водоёмов могут образовываться, например, сапропели — осадки, в которых содержание органического вещества превышает 30%. 1 Они формируются на дне застойных водоёмов в результате разложения обильных остатков растений и животных, при недостатке кислорода или в анаэробных условиях. 1