Формирование Алтайских гор происходило в несколько этапов: 12

1. В каледонскую эпоху возникли северо-восточные хребты, расположенные к востоку от Катуни. 4 Считается, что горы образованы в результате крупного столкновения островов в океане с блоками дуги палеоостровов. 1
2. В герцинскую эпоху, в конце палеозоя, дно моря смялось в складки, а внутренние силы подняли их вверх, образовав горную страну. 4 Горообразовательные движения сопровождались сильными извержениями вулканов, изливавшими лаву на поверхность молодых складок. 4
3. В мезозойскую эру Алтайские горы постепенно разрушались под действием солнца, ветра и других сил природы. 24 За миллионы лет бывшая горная страна превратилась в ровную обширную приподнятую равнину с одиночными возвышенными участками, выступающими в виде останцев. 4
4. В кайнозойскую эру на Алтае вновь возникли тектонические процессы альпийского горообразования, сформировавшие современный рельеф. 23 Ровные участки, состоящие из разрушенных складок, не могли больше сжиматься, так как горные породы были очень твёрдыми, земная кора потеряла свою подвижность. 4
5. В четвертичный период началось похолодание. 4 В Алтайских горах высокоподнятые плоские участки покрылись мощными толщами льда. 4 Ледники медленно сползали по склонам гор. 4
6. После первого оледенения начался межледниковый период, в течение которого возобновились тектонические движения. 4 Происходит опускание и поднятие суши по линиям старых и новых разломов. 4 К этому времени относится образование грабена Телецкого озера. 4

Дополнительным фактором, повлиявшим на алтайский рельеф, стали ледниковые процессы. 5 В результате передвижений больших ледовых масс образовались озёрные котловины и моренные холмы. 5