Некоторые природные процессы в Чёрном море, влияющие на его экосистему:

• Изменение стока рек. 1 После того как все крупные реки, впадающие в Чёрное море, зарегулированы, большая часть взвешенного кремния выпадает в донные отложения. 1
• Смешение прогретых и распресненных прибрежных вод с более холодными и солёными водами. 1 Это приводит к уплотнению и опусканию воды, а также к гравитационному оседанию органической и неорганической взвеси. 1
• Снижение солёности моря в прибрежных акваториях. 2 Это приводит к адаптации некоторых видов, например мидий, к жизни в пресных водах. 2

Кроме того, эвтрофикация (цветение воды) из-за переизбытка водорослей. 23 Растения используют большую часть кислорода, растворимого в воде, из-за чего животным и рыбам его не хватает, и они гибнут. 2