Уникальная флора и фауна Байкала связаны с его тектоническим происхождением через несколько факторов:

• Постоянные тектонические процессы. 1 Байкал находится на стыке двух континентальных плит — Евразийской и Амурской. 1 Это движение вызывает растяжение и расхождение берегов озера, что позволяет ему оставаться «молодым» и не подвергается обычным процессам заиливания и старения. 1
• Уникальная система вертикального водообмена. 1 Дважды в год происходят значительные колебания уровня воды, которые равномерно распределяют кислород по всему водоёму. 1 В большинстве других глубоких водоёмов кислород проникает лишь на расстояние 100 м, тогда как в Байкале живые организмы существуют даже на глубине 1642 м. 1
• Особый климат и природные условия. 24 Вокруг Байкала есть и болота, и степи, лесостепи, тундры, предгорные и горные леса, таёжные леса и скалистые вершины. 2 Благодаря особым природным условиям, которые создаёт озеро, вокруг него растёт и живёт множество редких, иногда эндемичных, видов. 2
• Периоды климатических изменений. 4 Байкал неоднократно проходил периоды драматических климатических изменений, сопровождающихся массовым развитием важнейших видов в его экосистеме или, напротив, массовой их гибелью. 4

В результате этих факторов в Байкале сформировалась разнообразная биота, где более 80% микроорганизмов являются эндемиками, то есть встречаются только здесь. 1 Среди них — байкальский омуль и живородящие рыбы голомянки, множество редких форм губок и рачков. 2