Поверхностный сток негативно влияет на экосистемы водоёмов, перенося загрязняющие вещества. 13 К ним относятся нефтепродукты, гербициды и удобрения. 1

Загрязнённые поверхностные воды могут:

• Повлиять на метаболические процессы водных видов. 1 Это может привести к гибели рыбы или изменить баланс существующих популяций. 1
• Изменить видовой состав. 2 Всёление инвазивных видов и вытеснение ими видов естественных условий. 2
• Ухудшить условия жизнедеятельности флоры и фауны. 2 Повышенная мутность воды не позволяет нормально проходить процессам фотосинтеза, а недостаток кислорода и химические загрязнения губительно действуют на обитателей водоёма. 4

Кроме того, поверхностный сток, возникающий в лесах, может обеспечивать озёра высоким содержанием минеральных азота и фосфора, что приводит к эвтрофикации. 1