Планктон влияет на состояние водной среды следующим образом:

• Зоопланктон потребляет природную взвесь, что приводит к увеличению прозрачности воды, уменьшению величин первичной продукции и активной реакции воды. 1 Также он выедает водоросли и бактерии, снижая их численность. 1 При этом, выделяя метаболиты, зоопланктон стимулирует развитие водорослей. 1
• Фитопланктон первым реагирует на изменение состояния водной среды. 5 Массовое развитие и отмирание его клеток ухудшает качество воды, приводит к появлению интенсивного запаха, повышению мутности и цветности воды, увеличению концентрации органических веществ. 7

Нектон также влияет на состояние водной среды, так как его представители, обитающие в толще воды и ведущие активный образ жизни (головоногие моллюски, рыбы, китообразные, ластоногие), могут влиять на биоту водоёма и его трофический статус. 25