Охрана водных биоресурсов в России осуществляется через ряд мер: 1

• Отображение в документах территориального планирования, градостроительного зонирования и документации по планировке территорий границ зон с особыми условиями использования (водоохранных и рыбоохранных зон, рыбохозяйственных заповедных зон) с указанием ограничений их использования. 1
• Оценка воздействия планируемой деятельности на биоресурсы и среду их обитания. 1
• Производственный экологический контроль за влиянием осуществляемой деятельности на состояние биоресурсов и среды их обитания. 1
• Предупреждение и устранение загрязнений водных объектов рыбохозяйственного значения, соблюдение нормативов качества воды и требований к водному режиму таких водных объектов. 1
• Установка эффективных рыбозащитных сооружений в целях предотвращения попадания биоресурсов в водозаборные сооружения и оборудование гидротехнических сооружений рыбопропускными сооружениями. 1
• Выполнение условий и ограничений планируемой деятельности, необходимых для предупреждения или уменьшения негативного воздействия на биоресурсы и среду их обитания. 1
• Определение последствий негативного воздействия планируемой деятельности на состояние биоресурсов и среды их обитания и разработка мероприятий по устранению этих последствий. 1
• Проведение мероприятий по устранению последствий негативного воздействия на состояние биоресурсов и среды их обитания посредством искусственного воспроизводства, акклиматизации биоресурсов или рыбохозяйственной мелиорации водных объектов. 1

Полномочия по охране водных биоресурсов и среды их обитания возложены на Федеральное агентство по рыболовству (Росрыболовство) и его территориальные органы. 3