Ушканьи острова на Байкале находятся под охраной государства, так как являются частью Забайкальского национального парка. 4

Некоторые меры, которые помогают сохранять природу островов:

• Ограничение посещения. 1 Для ограниченного посещения открыт остров Тонкий и часть острова Большой Ушканий. 1 Остров Большой Ушканий и Малые Ушканьи острова являются заповедной зоной и закрыты для посещения. 1
• Запрет на некоторые виды деятельности. 1 На островах не разрешается разбивать лагеря, устанавливать палатки, разводить костры, двигаться вне троп, собирать минералы и заниматься другими видами деятельности, которые нарушают целостность природных комплексов. 1
• Контроль за научно-исследовательскими работами. 1 Их можно проводить только при наличии договора о сотрудничестве между парком и соответствующим учреждением, в присутствии госинспектора или другого работника парка. 1
• Рекомендации для туристов. 4 Посетителям островов рекомендуется соблюдать правила и не беспокоить животных, чтобы сохранить их естественную среду обитания. 4

Кроме того, на острове Тонкий построены контрольно-наблюдательный пункт и музейно-информационный комплекс «Нерпа-центр», проложена экологическая тропа «К лежбищу байкальской нерпы». 5