Контроль за выполнением рейсов морских судов осуществляется несколькими способами:

1. Система управления движением судов (СУДС). 12 Она контролирует движение судов и положение их на якорных стоянках и выносных причальных устройствах. 2 СУДС передаёт на контролируемые суда информацию об изменениях судоходной обстановки, предупреждения о развитии опасных навигационных ситуаций и нарушении правил плавания и рекомендации в отношении дальнейших действий. 2 Также СУДС информирует капитана морского порта о выявленных опасных навигационных ситуациях или нарушениях правил плавания. 2
2. Система контроля за движением судов в акватории морского порта (СКУС). 12 Она обеспечивает разрешительный режим движения в акватории морского порта и на подходах к нему, выдавая судам разрешения на вход и/или выход, постановку на якорь или к причалу, а также на любое движение или перемещение судов в зоне ответственности СКУС. 1
3. Капитан морского порта осуществляет государственный портовый контроль. 5 Он проверяет наличие судовых документов, соответствие основных характеристик судов судовым документам и выполнение требований, касающихся безопасности мореплавания и защиты морской среды от загрязнения с судов. 5