Озера с двойным дном на месте торфяников могут образовываться из-за того, что сильноразложившиеся и водонасыщенные торфа занимают промежуточное положение в водном объёме озера, создавая «перекрытие» на определённой глубине. 2
Также двойное дно может формироваться в результате карстовых процессов, когда под первым дном оказывается пещера, также заполненная водой. 25 Карстовые породы, такие как известняк, легко растворяются водой, образуя подземные полости и ходы. 5
Кроме того, геологические особенности могут создавать слоистую структуру дна: например, слой песка может лежать поверх слоя глины, и если верхний слой песка достаточно толстый, он может создать эффект двойного дна. 5
Иногда двойное дно создаётся искусственно: например, при строительстве дамб или плотин на дне озера могут оставаться затопленные конструкции, создающие иллюзию второго дна. 5