Карликовые крокодилы обитают в тропических регионах Западной и Центральной Африки, к югу от Сахары. 13

Эти рептилии предпочитают жить в пресноводных водоёмах, таких как ручьи, небольшие реки, болота, заводи и мангровые заросли. 3 Обычно они избегают основных участков крупных рек. 3

Большая часть ареала карликовых крокодилов находится в лесных районах, но они могут встречаться и в более открытых местах, где ручьи или реки хорошо затенены. 3 Также их можно увидеть в сезонно затопляемых лесах. 3

Во время засухи карликовые крокодилы роют норы длиной до 2–3 метров и впадают в спячку в них вплоть до наступления сезона дождей. 2

Пик активности этих животных приходится на ночное время суток, днём они в основном прячутся в затопленных корнях деревьев или в норах, часто с подводным входом. 2