Нитрификация влияет на биологический круговорот азота в природе следующим образом:

• Переводит азот из аммонийной формы в нитратную. 3 Это способствует обеднению почвы азотом, поскольку нитраты легко вымываются из неё. 3
• Делает нитраты доступным источником азота для растений. 35 Растения используют нитраты для образования разных органических веществ. 25
• Улучшает растворимость и доступность некоторых жизненно необходимых элементов. 3 Связанное с нитрификацией подкисление почвы повышает растворимость фосфора и железа. 3

Однако процесс нитрификации является нежелательным, поскольку значительные потери азота происходят при денитрификации и вымывании нитратов. 4 Кроме того, нитраты могут легко накапливаться в растениях и делать сельскохозяйственную продукцию опасной для человека и животных. 4