Нитрифицирующие бактерии положительно влияют на окружающую среду и экосистему водоёмов. 3 Они осуществляют часть замкнутого цикла основного биогенного элемента — азота, который задействован в потоке энергии в водной среде. 3

Влияние нитрифицирующих бактерий заключается в следующем:

• Окисляют аммоний до нитрита. 1 В результате реакции помимо нитрита получается водород и вода и выделяется энергия, которую бактерии используют для своей жизнедеятельности. 1
• Полученный нитрит другие нитрифицирующие бактерии окисляют до менее токсичного нитрата. 1 Большинство получившегося нитрата потребляется растениями для своего роста. 1

Также нитрифицирующие бактерии участвуют в процессе биологического самоочищения водоёма, разлагая органические соединения. 2

Кроме того, азотный обмен, который происходит благодаря нитрифицирующим бактериям, влияет на развитие планктона, который служит кормовой базой для гидробионтов (рыб, ракообразных и т. п.). 3