Микроорганизмы могут способствовать решению экологических проблем следующим образом:

• Борьба с пластиковым загрязнением. 1 Некоторые микроорганизмы способны разлагать пластик, например, бактерия Ideonella sakaiensis. 15
• Ликвидация разливов нефти. 1 Для этого используют нефтеразлагающие бактерии, которые, например, сыграли ключевую роль в избавлении от загрязнения после разлива нефти в Мексиканском заливе в 2010 году. 1
• Получение энергии из органических отходов. 13 При разложении органических отходов микроорганизмы выделяют биогаз, который можно сжигать для получения электричества, отопления и в качестве топлива для автомобилей. 1
• Очистка загрязнённой почвы (биоремедиация). 4 Для этого в почву вносят микроорганизмы, которые используют в качестве источника своего питания загрязняющие вещества. 4 В результате жизнедеятельности микроорганизмов загрязняющие вещества преобразуются в безопасные соединения, такие как углекислый газ и вода. 4