Масс-спектрометрия используется в экологии и охране окружающей среды для количественного и качественного определения загрязняющих веществ любого типа в образцах объектов окружающей среды любой сложности. 13

Метод позволяет определять молекулярную массу, молекулярную формулу, строение вещества, распределение компонентов по образцу. 1 С помощью масс-спектрометрии можно детектировать как неорганические вещества (от водорода до урана), так и органические и даже высокомолекулярные соединения: синтетические полимеры, полипептиды, белки и другие. 1

Ещё одно направление использования масс-спектрометрии в экологии — масс-спектрометрия изображений (имиджинг). 5 Этот метод позволяет детектировать и картировать распределение тысяч самых разнообразных соединений в органах и тканях животных и растений, в минералах, овощах и фруктах. 5