Климат и течения влияют на экосистему Филиппинского моря следующим образом:

• Климат. Море расположено в четырёх климатических поясах: субтропическом, тропическом, субэкваториальном и экваториальном. 5 Тёплое Северо-Пассатное течение немного смягчает местный климат. 1 Однако в период с конца мая до начала октября над морем часто бушуют ураганы, тайфуны и цунами. 2
• Течения. Система западных пограничных течений, включая Северное экваториальное течение, течение Куросио, течение Минданао и субтропическое противоточие, влияет на характер распределения и процессы переноса личинок рыб в Филиппинском море. 3 Например, мезомасштабные вихри могут перемещать богатую питательными веществами глубокую воду в поверхностный слой, способствуя первичной продуктивности и поддерживая большее количество личинок рыб. 3

Кроме того, разнообразные среды обитания в Филиппинском море, включая коралловые рифы, луга морской травы и мангровые леса, служат ценными местами размножения и питомниками для многочисленных морских видов. 4