Режим реки Анадырь изменяется в разные сезоны следующим образом:
- Весной наблюдается высокое половодье. 12 Начало приходится на май, пик — на середину июня, окончание — на первую половину июля. 1 В верховьях уровни воды поднимаются на 4–5 м, в нижнем течении реки величина подъёма уровня составляет 6–8 м. 1
- В тёплое время года характерна неустойчивая межень, прерываемая двумя-тремя небольшими дождевыми паводками. 2 Наивысшие паводки возможны главным образом в августе, тогда уровень воды поднимается на 0,5–2 м, а иногда гораздо больше. 2
- Зимой фиксируются очень низкие уровни воды вследствие малых запасов грунтовых вод в условиях вечной мерзлоты. 2 В течение всего зимнего сезона сток наблюдается только в нижнем течении реки. 1
Также на изменение уровня воды в реке влияют приливы Берингова моря и сгонно-нагонные явления, которые наблюдаются в устье. 23