Некоторые изменения системы реки Муррей за последние десятилетия:

• Обмеление реки. 15 Многие притоки пересыхают, не достигая главного русла, и Муррей сильно мелеет. 45
• Использование воды для орошения. 15 До 95% забранной из реки воды применяется для орошения прилегающих полей, на которых выращивается до 40% всей сельхозпродукции Австралии. 15
• Влияние на экосистему. 3 Введение насосных станций вдоль реки способствовало расширению сельского хозяйства, но нарушило жизненные циклы многих экосистем как внутри, так и за пределами реки. 3
• Влияние на лагуну Те-Куронг. 4 Сокращение стока воды Муррея вызвало увеличение солёности воды в лагуне, с 1980-х годов в ней существенно сократилась численность перелётных птиц и многих видов рыб. 4

В прошлом река Муррей неоднократно меняла русло. 5 Крупная древняя дельта реки до сих пор видна на карте в районе Аделаиды, где также было много древних пресных озёр. 5