Географическая принадлежность озера Ханка исторически формировалась следующим образом:

В прошлом к водосбору Ханки также относился бассейн реки Раздольной. 1 Ханкайская котловина представляет собой синклиальный прогиб, в котором в разные периоды кайнозоя возникали озёра. 1 Решающую роль при этом играла аккумуляция аллювия, благодаря чему конфигурация озёр менялась. 1

Аккумуляция водных отложений в котловине озера Ханка оставалась значительной до тех пор, пока сюда впадала река Раздольная. 1 Позднее речная сеть Раздольной перестроилась, река стала впадать в Японское море и поступление отложений в южную часть Ханкайской котловины резко сократилось. 1 Уровень воды в озере поднялся и постепенно оно приняло современные очертания. 1

В современных границах озеро существует лишь последние три тысячи лет. 1 Северная часть озера (Малая Ханка) принадлежит Китаю, а южная часть располагается на территории России. 3