В судоходстве Брахмапутра используется как важнейшая воднотранспортная артерия в Индии и Бангладеш. 5 Река судоходна на протяжении 1290 км от моря. 5 В 1990-х годах участок между городами Садийя (на притоке Брахмапутры Лухите) и Дхубри (на Брахмапутре) был объявлен Национальным водным путём Индии №2 (после Ганга). 5 По реке перемещаются моторные катера и пароходы, которые перевозят крупногабаритное сырьё, древесину и сырую нефть. 2

В энергетике Брахмапутра обладает одним из наибольших гидроэнергетических потенциалов среди других рек мира. 1 Однако энергетическое использование реки и притоков незначительно из-за политико-территориальных проблем, труднодоступности района, его сейсмоактивности и удалённости основных рынков сбыта. 1

С 2012 года на самой реке нет действующих ГЭС. 1 В бассейне реки есть ГЭС, которые предназначены для снижения паводков, орошения и выработки электричества. 1 Например, в Индии наиболее крупный проект в бассейне — ГЭС Дибанг на одноимённой реке, с высотой гравитационной плотины 288 м и мощностью 3 ГВт. 1