Использование нескольких учётных записей WhatsApp в целом не должно негативно влиять на безопасность данных. 1
В мессенджере предусмотрено сквозное шифрование, которое обеспечивает безопасность чатов. 1 Кроме того, параметры конфиденциальности и уведомлений для каждого аккаунта можно настроить отдельно. 34
Однако для защиты конфиденциальности и избегания возможных рисков безопасности рекомендуется использовать надёжные методы, например, облачные телефоны. 1