Грабены могут влиять на формирование озёрных впадин следующим образом: в днищах грабенов возникают обширные депрессии, состоящие из термокарстовых озёрных котловин и соединяющих их долинообразных понижений. 1

Например, на шельфе моря Лаптевых озерный термокарст, возникший на осушенном шельфе, был приурочен к понижениям рельефа, соответствующим грабенам. 1 Это определило опережающее затопление грабенов по сравнению с возвышенностями. 1

Также грабены могут быть местом образования крупных озёрных котловин ледникового генезиса, которые встречаются на днищах горных долин. 3