Гора Ямантау влияет на климат и экологию региона следующим образом:

Климат: в районе горы господствует резко континентальный климат, довольно суровый и сухой, с долгой и морозной зимой и коротким умеренно тёплым летом. 2 В течение года выпадает до 1100 мм осадков. 2 Иногда снежный покров достигает толщины в 100 см и лежит достаточно долго, более 200 дней в году. 2 Температура воздуха в зимние месяцы опускается в среднем до -17 °C, летом воздух прогревается до +16 °C. 2

Экология: гора находится на территории Южно-Уральского заповедника, который отличается уникальным биологическим разнообразием. 12 Здесь растёт около 700 видов различных растений, среди которых насчитывается 57 реликтовых видов. 2 Огромную территорию у горы Ямантау занимает лес, где главенствуют хвойные породы деревьев, такие как ель и пихта сибирская. 2 Здесь можно встретить лиственницу Сукачёва и сосну обыкновенную. 2 Кустарники, растущие здесь, такие как волчье лыко, можжевельник и курильский чай, занесены в Красную книгу региона. 2