Дрозофилы могут влиять на экологическую ситуацию в местах их обитания следующим образом:

• Служат биоиндикаторами загрязнения среды. 13 С их помощью можно оценить токсичность среды и её благоприятность, например, по соотношению полов, количеству летальных особей, появлению морфозов, продолжительности жизни. 1
• Адаптируют к условиям загрязнения. 2 Например, при нефтяном загрязнении среды дрозофилы могут адаптироваться к нему и противостоять дальнейшему нарастанию концентрации загрязнителя. 2
• Помогают определить концентрацию тяжёлых металлов в почвах. 3 Для этого используют биотест с дрозофилами, наблюдая за мутагенезом мух, по результатам которого можно оценить наличие и концентрацию тяжёлых металлов в почвах. 3