Деятельность человека негативно влияет на экосистему устьев рек, вызывая различные проблемы, среди которых:

• Техногенная трансформация. 1 Создание гидротехнических сооружений, спрямление и углубление речных долин, использование рек для проходки судов — всё это меняет облик и режим устьевых областей. 1 Это усиливает вероятность негативных последствий штормовых наводнений. 1
• Загрязнение. 14 Сброс неочищенных сточных вод, утечки нефти и нефтепродуктов, смыв ядохимикатов ливневыми осадками — всё это ухудшает качество воды в устьях рек. 14 Загрязнение приводит к дефициту кислорода в воде, сероводородному заражению, заморам рыб и других организмов. 1
• Изменение гидрологического режима. 1 Снижение стока, изменение скорости и объёма воды — всё это влияет на экосистему устьев рек, уменьшая кормовую базу и сокращая численность рыб, беспозвоночных и других организмов. 1
• Деградация ландшафтов. 1 Затопление, подтопление, переувлажнение почв, оползни — всё это происходит из-за деятельности человека и приводит к нарушению производственной деятельности на затапливаемых территориях. 1
• Обмеление рек. 5 Например, при крупномасштабных лесозаготовках из-за обнажения площадей водосборов меняется водный режим рек, что приводит к их обмелению, перестройке биоценотических связей и нарушению естественных путей миграций рыб. 5