Чрезмерная эксплуатация подземных вод может негативно сказаться на экологии, вызывая различные проблемы, среди которых:

• Истощение запасов подземных вод. 14 Интенсивная откачка для водопотребления, орошения сельскохозяйственных земель и зелёных насаждений, водопонижения при строительстве котлованов и добыче полезных ископаемых и т. д. приводит к тому, что запасы подземных вод истощаются быстрее, чем восстанавливаются. 4
• Обмеление рек и озёр. 4 Из-за чрезмерной откачки подземных вод мелеют и пересыхают реки и озёра, нарушаются их экосистемы. 4
• Оседание поверхности земли. 4 В районах крупных откачек уровни напорных вод могут снизиться на десятки и даже сотни метров. 4 Это приводит к образованию депрессионных воронок и оседанию поверхности земли. 4
• Загрязнение подземных вод. 5 В результате большого количества пробуриваемых скважин в подземные воды попадают загрязняющие вещества, такие как нефтепродукты, нитриты, патогенные бактерии. 5
• Осушение и исчезновение болот. 2 Отбор подземных вод может привести к осушению и даже исчезновению низинных болот, что вызывает угнетение болотной фауны и флоры. 2
• Увеличение частоты и интенсивности природных катастроф. 1 Изменение уровня грунтовых вод влияет на геологическую стабильность региона, что может привести к оползням и землетрясениям. 1

Для минимизации негативного воздействия на экосистемы необходим контролируемый отбор подземных вод на основе постоянного мониторинга и управления их режимом. 4