Человеческая деятельность негативно повлияла на флору и фауну Майотты. 1

Флора. 1 Большая часть территории острова была преобразована человеком. 1 Большую долю занимают плантации различных древесных и кустарниковых растений. 1 Естественная растительность состоит из тропических лесов с видами деревьев, частично и полностью теряющих листья в сухой сезон. 1 На Майотте много пальм, главным образом кокосового ореха. 1 Также на острове есть много видов полезных растений, таких как ваниль, кофейное дерево и сахарный тростник. 1 Леса в настоящее время занимают около 10% территории страны. 1

Фауна. 1 Животный мир в значительной степени истреблён. 1 Фауна принадлежит к Мадагаскарской области, где обитает множество эндемичных видов. 1 В лесах живут обезьяны и многие виды птиц, включая морских птиц. 1 Прибрежные воды изобилуют ракообразными и рыбой, которые вылавливаются, покрывая собственные и экспортные потребности Майотты. 1

Кроме того, на Майотте распространено браконьерство, в частности, на морских черепах. 2