Биологические методы мониторинга применяются для оценки экологического состояния следующим образом:

1. Биоиндикация. 13 Это комплексная оценка интенсивности и последствий длительного загрязнения окружающей среды или другого воздействия на неё по наличию индикаторных организмов, таксономическому составу ценозов, нарушениям в функционировании сообщества либо по другим отклонениям в нормальном развитии организмов. 1 С помощью биоиндикаторов можно обнаруживать места скоплений в экологических системах различного рода загрязнений и прослеживать скорость происходящих в окружающей среде изменений. 3
2. Биотестирование. 13 Это процедура установления токсичности среды с помощью тест-объектов. 3 Для оценки параметров среды используются стандартизованные реакции живых организмов (или отдельных органов, тканей, клеток и молекул). 3 В организме, пребывающем контрольное время в условиях загрязнения, происходят изменения физиологических, биохимических, генетических, морфологических параметров. 3 Объект извлекается из среды обитания, и в лабораторных условиях проводится необходимый анализ. 3

Методы биомониторинга применяются при анализе содержания вредных веществ в водных средах, почвах, атмосфере, растительных и животных объектах. 3