Биогенные вещества (остатки древних живых организмов) влияют на развитие нефтяных месторождений, согласно биогенной теории происхождения нефти. 45

Некоторые процессы, которые происходят под влиянием биогенных веществ:

• Останки умерших организмов вместе с илом уходят всё глубже и со временем превращаются в нефтематеринскую породу (нефтяные или горючие сланцы). 4 Органический материал в этих сланцах называется кероген. 4 При определённой температуре и давлении кероген преобразуется в нефть. 4
• Жидкие нефтяные углеводороды имеют повышенную подвижность, и микронефть может мигрировать из нефтематеринских пород по коллекторам, собираясь в ловушках. 5
• Микроорганизмы на нефтяных месторождениях играют важную роль в различных процессах, включая деградацию нефти, биокоррозию и биоремедиацию. 2 Некоторые из них могут улучшать качество нефти, удаляя серу, парафины и тяжёлые металлы из тяжёлой нефти. 2

Однако деятельность некоторых микроорганизмов, например сульфатвосстанавливающих бактерий, может наносить экономический и экологический ущерб, сокращая сроки службы трубопроводов и резервуаров и создавая аварийные ситуации. 1