Чёрный хорёк обитает в небольших лесных массивах, отдельных рощах. 1 Предпочитает селиться на опушках и полянах, при этом избегает сплошных таёжных массивов. 2

Также хорёк часто встречается в поросших растительностью поймах небольших рек и рядом с другими водоёмами: старицами, озёрами, ручьями, каналами, прудами, водохранилищами и затопленными карьерами. 2 Ещё он может жить на окраинах болот или на болотных островках. 2

Кроме того, чёрный хорёк селится в садах, городских парках и на окраинах населённых пунктов, в том числе таких крупных городов, как Москва. 2 В поисках добычи он может добираться даже в центры городов, в том числе заходя в здания, включая жилые. 2