Зизифора в природе растёт на лугах, щебнистых и каменистых склонах, скалистых берегах рек в Средиземноморье, Европе, Передней и Средней Азии. 5

Например, в Узбекистане виды зизифоры распространены на каменистых и щебнистых склонах от предгорий до среднего пояса гор, в том числе на хребтах Тянь-Шаня и Памиро-Алая. 1

В Ростовской области зизифора головчатая растёт преимущественно на степных и каменистых склонах, на заброшенных полях. 2

Также зизифора встречается на склонах гор Алтая. 4

Кроме того, в Казахстане зизифора широко распространена, за исключением центральных пустынь, и наиболее обильна в горах Тянь-Шаня. 3