Вахта трёхлистная в естественных условиях растёт в умеренном климате Северного полушария в Азии, Америке и Европе, в том числе в лесах европейской части России, а также Сибири и Дальнего Востока, а также в заболоченных лесных районах Беларуси и Украины. 1

Чаще всего встречается на сырых местностях, болотах, торфяниках и минеральных грунтах, а также по берегам рек, озёр, прудов, на болотистых лугах и в стоячей воде. 1

Вахта может быть одним из компонентов травяно-кустарничкового яруса болот, влажных лесов и лугов. 3 Как правило, образует значительные заросли, произрастая в соседстве с белокрыльником, осоками, хвощами, сабельником. 1