Кизильник черноплодный растёт в Северной, Восточной, Юго-Восточной и Центральной Европе, на Кавказе, в Западной и Восточной Сибири, Центральной Азии, на территории Китая, Монголии и Турции. 2 Возможно, произрастает на Дальнем Востоке России. 2

Растение предпочитает расти на каменистых склонах, в зарослях, светлых лесах, редколесье. 2 Поднимается до высоты 2600 м. 2

Также кизильник черноплодный растёт по известковым и меловым горам в чернозёмных и степных местностях средней полосы. 1 Предпочитает полог различных, но негустых лесов, заросли кустарников, луговые степи, каменистые и щебнистые склоны и скалы. 1