Заповедник «Красноярские Столбы» находится на северо-западных отрогах Восточного Саяна, вблизи города Красноярска. 13
Территория ограничена реками: на северо-востоке её рубеж образует река Базаиха, а на юге и юго-западе — реки Мана и Большая Слизнева. 13 С северо-восточной стороны заповедник непосредственно примыкает к Красноярску. 1
Координаты: 55°53′ с. ш., 92°46′ в. д.. 3