Скопления магнетита в природных условиях можно обнаружить в разных местах, например:

• В магматических горных породах. 35 Магнетит обычно наблюдается в виде вкраплённости. 35 С основными породами (габбро) нередко связаны магматические месторождения титаномагнетита в виде неправильной формы скоплений и жил. 35
• В карбонатитах. 23 Например, на Кольском полуострове крупное месторождение магнетита приурочено к массиву карбонатитов (Ковдор). 3
• В скарнах. 23 Мощные магнетитовые залежи располагаются среди гранатовых, пироксено-гранатовых и гранат-эпидотовых скарнов, образовавшихся при воздействии гранитной магмы на известняки. 3 Пример такого месторождения — гора Магнитная (Южный Урал). 3
• В регионально-метаморфических образованиях — железистых кварцитах, джеспилитах. 2 К ним относятся, например, Криворожский железорудный бассейн (Украина), Курская магнитная аномалия (Россия), Костомукшское месторождение (Карелия, Россия). 2
• В осадочных породах, включая образования полосчатого железа, а также в озёрных и морских отложениях. 1

Некоторые места, где были обнаружены крупные месторождения магнетита: регион Атакама в Чили, регион Валентинес в Уругвае, Кируна в Швеции, горы Адирондак в Нью-Йорке (США). 1