Да, в магистратуре есть военная кафедра. 1

Согласно постановлению правительства РФ от 06.03.2008 №152, студенты высших учебных заведений могут изучать учебные дисциплины военной программы совместно с дисциплинами по образовательной программе. 1

Например, выпускник бакалавриата, поступивший на программу подготовки офицеров запаса, продолжает обучаться на ней в течение 1–2 курсов магистратуры. 4 Если во время обучения в бакалавриате студент не поступил на военную кафедру, то в магистратуре у него есть возможность пройти обучение по программе подготовки солдат и сержантов запаса (в течение 1–2 курсов). 4

Информацию о наличии военной кафедры в конкретном вузе рекомендуется уточнять на сайте университета или в приёмной комиссии. 24