Некоторые особенности экосистемы Дагестанского заповедника:

• Разнообразие природных зон. 3 На территории представлены четыре стихии: горы, море, пустыни и леса. 23
• Бархан Сарыкум. 34 Это визитная карточка заповедника, единственный в России пример «чистой» песчаной пустыни с многокилометровыми дюнами. 4 В песках водятся насекомые, змеи, средиземноморские черепахи и ящерицы. 3
• Самурский лес. 3 Занимает значительную территорию вдоль реки Самур и уникален климатическими условиями — здесь царят тёплые полувлажные тропики. 3 Ещё одна примечательная особенность — обилие лиан, лес напоминает непроходимые джунгли, что нетипично для России. 3
• Кизлярский залив. 3 Примыкает к западному берегу Каспийского моря, мелководен и опреснен, дно покрыто значительным слоем ила. 3 В нём сложилась уникальная фауна — тут проживает основная часть пернатых заповедника и более 70 видов ихтиофауны. 3
• Гнездовья редких птиц. 2 В заливах северной части Каспийского моря под охраной находится мир редких птиц. 2 Здесь сосредоточены самые большие в мире гнездовья кудрявого пеликана — одного из символов Дагестанского заповедника. 2