В водоохранных зонах рек и озёр запрещено совершать действия, которые могут привести к загрязнению, засорению или истощению водных объектов. 12

Некоторые запреты, установленные статьёй 65 Водного кодекса РФ: 14

• Использовать сточные воды для регулирования плодородия почв. 12 Например, нельзя вносить осадок сточных вод в качестве удобрения. 1
• Размещать кладбища, скотомогильники, отходы производства и потребления, химические, взрывчатые, токсичные, отравляющие и ядовитые вещества, пункты захоронения радиоактивных отходов. 24
• Уничтожать вредные организмы при помощи авиации (например, сбрасывать из самолёта химикаты на насекомых). 2
• Использовать транспортные средства (кроме специальных), движение допускается только на дорогах, а стоянки — на дорогах и в оборудованных местах с твёрдым покрытием. 24
• Строить и содержать АЗС и склады горюче-смазочных материалов. 2
• Хранить и применять пестициды и агрохимикаты. 2
• Сбрасывать сточные, в том числе дренажные воды. 12
• Проводить разведку и добычу полезных ископаемых (за исключением случаев, если они осуществляются пользователями недр). 2

В границах водоохранных зон есть прибрежные защитные полосы, в которых действуют дополнительные ограничения. 2

За нарушение правил использования водоохранных зон предусмотрена административная ответственность. 15