Некоторые особенности, которые делают уникальными Голубые озёра:

• Холодноводность. 1 Температура воды в озёрах постоянная в течение года (6–8 °С). 1
• Высокая прозрачность. 1 Дно озёр просматривается до глубины 22 метров. 3
• Необычный цвет. 1 Его учёные связывают с сульфидом кальция: в холодной воде он почти не растворяется, и пока озёра не прогреваются, они остаются бирюзовыми. 1
• Наличие солевой грязи. 1 На дне озёр наблюдается большой слой солевой грязи, очень богатой минеральными веществами. 1

Например, Голубые озёра в Кабардино-Балкарии отличаются ещё и тем, что из-за поверхностных и подземных вод здесь есть особые формы рельефа — подземные пещеры, провалы, воронки. 2