Убсунурская котловина уникальна как объект Всемирного наследия ЮНЕСКО по нескольким причинам:

• Разнообразие ландшафтов. 14 На относительно небольшой территории представлены почти все природные зоны Земли, за исключением саванны и джунглей. 15 Здесь есть глинистые и песчаные пустыни, высокотравные сухие степи, лесостепи, массивы горной тайги, альпийские тундры и ледники. 15
• Контрастность климата. 1 В котловине наблюдается уникальный котловинный тип климата, где аридность увеличивается от периферии к центру. 1 Это позволяет существовать на ограниченном пространстве разнообразным природным зонам. 1
• Видовое разнообразие. 3 В котловине сочетаются северные (таёжные, сибирские) и более южные (пустынные, центральноазиатские) виды растений и животных. 3 Здесь обитают, например, снежный барс, верблюд, пустынная ящурка, белая куропатка, архар и сурок-тарбаган. 45
• Археологические находки. 1 В котловине обнаружено множество археологических находок, которые говорят о богатом культурном наследии этого региона. 1 Здесь найдены захоронения, каменные изваяния, курганы и доисторические наскальные рисунки эпохи бронзового века. 5
• Научное значение. 2 В заповеднике находятся остаточные плейстоценовые ледники и многочисленные ледниковые озёра, которые имеют особое научное значение для изучения эволюции Ледникового периода в современных условиях. 2