Высокогорный комплекс Кузнецкого Алатау уникален по нескольким причинам:

• Расположение ледников. 13 В этом комплексе ледники находятся на необычно низких высотах для внутриматериковых областей северного полушария — 1200–1500 м над уровнем моря. 23 Ни в одном из внутриконтинентальных районов северного полушария в аналогичных широтах ледники не обнаружены. 2
• Высокогорные озёра. 1 Они расположены выше 1000 м над уровнем моря. 1 Например, Среднетерсинское озеро — самое глубокое в Кузбассе, его глубина составляет более 60 м. 2 Озеро Рыбное — самое большое горно-ледниковое озеро Кемеровской области, его длина — 1000 м, ширина — 500 м. 2
• Разнообразие флоры и фауны. 1 В заповедной зоне Кузнецкого Алатау представлено 618 видов флоры, из них 135 включены в Красную Книгу России. 1 Здесь сосуществуют сразу четыре растительных пояса: тайга, субальпийские и альпийские луга и горная тундра. 1
• Особый тип тайги. 4 В районе Кузнецкого Алатау сформировался особый тип тайги — черневая, которая характеризуется буйством трав, высоким подлеском с преобладанием влаголюбивых древесных пород — берёза, осина. 4 Доминирующий тип хвойных пород — пихта. 4