Природный парк «Золотые горы Алтая» уникален с точки зрения биоразнообразия сочетанием высотных поясов растительности. 1 Здесь представлены степи, лесостепи, смешанные леса, субальпийские и альпийские сообщества, а также уникальные тундро-степи, распространённые на высокогорном плоскогорье Укок. 1

Фауна парка также разнообразна. 2 Здесь обитают, например:

• более 70 млекопитающих, в том числе краснокнижные снежный барс, аргали, сибирская кабарга; 2
• более 330 птиц, включая степного орла, скопу, журавля-красавку, сапсана, филина Bubo; 2
• 20 видов рыб: благородные — хариус, телецкий сиг, таймень. 2

Кроме того, территория является важным местообитанием находящихся под угрозой исчезновения видов животных, в том числе снежного барса и алтайского аргали. 1