Зубцы Ай-Петри с точки зрения геологии примечательны тем, что представляют собой ископаемый риф. 14 Рифовый известняк, из которого они образованы, состоит из окаменевших колониальных кораллов и водорослей, обитавших на дне мелководных участков позднеюрского моря. 14

Миллионы лет назад здесь была отмель, заселённая кораллами. 1 Когда в результате движения плит земной коры дно океана опустилось, а риф оказался на поверхности, кораллы перестали разрастаться. 2 С этого момента они начали твердеть и подвергаться выветриванию, в результате которого и образовались современные зубцы. 2

Рифовые известняки Ай-Петри очень мощные и уходят вглубь на 600 метров. 1 Это говорит о том, что дно позднеюрского моря медленно опускалось, а нараставшие поколения кораллов всё время оказывались в благоприятных условиях. 1