Ихтиофауна озера Селигер примечательна разнообразием видов. 25 В нём обитает около 30 видов рыб, в том числе лещ, окунь, щука, судак, плотва, много снетка. 25 Реже вылавливаются язь, линь, карась, налим, ряпушка, верховка, пескарь. 5 В единичных экземплярах встречаются сиг, хариус, голавль, жерех, чехонь, карп, краснопёрка, минога, елец, щиповка, подкаменщик, вьюн. 5

По характеру ихтиофауны озеро относится к типу лещевых озёр и смешанному подтипу лещево-снетковых и окунево-плотвичных озёр. 3