Скелетный дизайн уступает плоскому по следующему принципу: плоский дизайн упрощает и стилизует элементы под плоскую печатную графику, а скелетный дизайн имитирует реальные объекты и их свойства. 1

Некоторые другие отличия:

• Время загрузки. 5 Плоский дизайн обычно быстрее загружается, так как в нём отсутствуют «тяжёлые» скевоморфические детали (слои, шрифты с засечками, градиенты). 5
• Инклюзивность. 1 Некоторые элементы плоского дизайна менее доступны для пользователей с ограниченными возможностями зрения, так как без объёмных эффектов и контрастов различить части интерфейса на маленьком экране сложнее. 1
• Потеря контекста и смысла. 1 Из-за упрощённого стиля элементы иногда становятся совсем непонятными, особенно если они не подкреплены текстовыми пояснениями. 1