Вопросы к Поиску с Алисой
Яма на дороге — общее название углубления в земле. {7-host} Может быть огромной, например, как провал, в который провалится машина. {7-host}
Выбоина — участок на асфальтированной дороге, размеров от 20 см до метра, на котором повреждено твёрдое покрытие, и получилась яма. {7-host} При проезде по выбоинам получаются резкие толчки, и возможны повреждения колёс. {7-host}
Рытвина — углубление на дороге, выбитое колёсами или вымытое дождями. gramota.ru kartaslov.ru
Таким образом, основное отличие в том, что яма — общее название углубления в земле, а выбоина и рытвина — это конкретные виды неровностей на дороге.