Некоторые отличия системы прослеживаемости товаров от системы маркировки:

• Объект контроля: при маркировке — каждая единица товара, при прослеживаемости — вся партия ввезённого из-за границы товара. 16
• Способ идентификации: маркировка наносится на сам товар, а о том, что товар подлежит прослеживаемости, можно узнать из документов на него (там будет указан регистрационный номер ввезённой партии). 1
• Цель: маркировка помогает препятствовать распространению контрафактной продукции, а основная цель прослеживаемости — не допустить уклонения от уплаты налогов и таможенных сборов. 1
• Участники товарооборота: маркировка в основном затрагивает только производителей и импортёров, а прослеживаемость товаров — все группы участников товарооборота. 4
• Отчётность: информация о маркированных товарах содержится в системе «Честный знак» (производители и продавцы добавляют туда сведения самостоятельно). 1 Участники оборота прослеживаемых товаров должны направлять уведомления о каждом этапе перемещения товара, а также сдавать отчёты и декларации по НДС. 1
• Ответственность: за нарушение требований о маркировке предусмотрены штрафы, а за нарушение законодательства о прослеживаемости, по плану, начнут наказывать с 2025 года. 1

Продукция не может быть одновременно прослеживаемой и маркируемой. 10