Санитарная обрезка и формирующая имеют разные цели.

Санитарная обрезка направлена на чистку кроны растений и формирование их общего иммунитета. 1 Её проводят, чтобы удалить повреждённые, сломанные, засохшие ветви, вырезать заражённые побеги, чтобы избежать распространения болезни. 4 Санитарную обрезку можно проводить в любое время года, единственное условие — устойчивая положительная температура воздуха. 4

Формирующая обрезка проводится с первого года жизни молодых деревьев и направлена на формирование скелетных ветвей, повышение устойчивости растения и регулирование его внешнего вида. 1 Основная задача такой обрезки — стимулирование наиболее мощных побегов к росту и плодоношению. 3 Попутно удаляются совсем или укорачиваются ветки, растущие в нежелательном направлении. 3

Таким образом, санитарная обрезка фокусируется на сохранении здоровья растений, а формирующая — на формировании определённой формы кроны и улучшении внешнего вида растения.